Die Anfänge von Bodenstadt reichen bis an die Wende vom 13. zum 14. Jahrhundert zurück, als das Gebiet im Zuge der Kolonisation entlang der Handelsstraße nach Troppau und weiter nach Polen von tschechischen und deutschen Siedlern erschlossen wurde. Die erste schriftliche Erwähnung der Stadt stammt aus den Jahren 1318–1322, als Zawisch von Bodenstadt seine Besitzungen an den Olmützer Bischof Konrad verkaufte. Bereits zu dieser Zeit besaß Bodenstadt städtischen Charakter, worauf auch der vom Gründer Puta abgeleitete Ortsname verweist. In der zweiten Hälfte des 14. Jahrhunderts gelangte die Stadt in den Besitz der Herren von Kunstadt und Podiebrad. Im Jahr 1388 verlieh Boček von Kunstadt Bodenstadt das Privileg eines Brauberechtigungsbrauhauses und legte damit den Grundstein für das privilegierte Braubürgerwesen. Sechs Jahre später, 1394, erhielt die Stadt das Olmützer Stadtrecht sowie umfangreiche Marktprivilegien, die den Bewohnern der umliegenden Dörfer vorschrieben, ihre Waren vorrangig in Bodenstadt anzubieten. Diese Rechte förderten die Entwicklung des Handwerks und des Handels.

Im Jahr 1408 erwarb Tas von Prusinowitz die Herrschaft Bodenstadt; seine Nachkommen nahmen später den Namen Podstatzky von Prusinowitz an. Unter ihrer Herrschaft setzte sich die Entwicklung der Stadt fort, neue Handwerke entstanden und weitere städtische Privilegien wurden verliehen. Zu Beginn des 17. Jahrhunderts wurde ein Renaissanceschloss errichtet. Nach der Niederschlagung des Böhmischen Ständeaufstandes im Jahr 1621 wurde der Besitz der Familie Podstatzky konfisziert und fiel an Karoline d’Austria-Contecroix. Der Dreißigjährige Krieg brachte der Stadt schwere Verwüstungen; zwischen 1642 und 1645 wurde die Herrschaft wiederholt von schwedischen und kaiserlichen Truppen geplündert und erlitt erhebliche Schäden. An der Wende vom 17. zum 18. Jahrhundert wurde Bodenstadt unter der Herrschaft der Familie Walderode im barocken Stil neu gestaltet. In dieser Zeit entstanden die Mariensäule, die Kalvariengruppe, der Uhrturm, die Statue des heiligen Florian sowie die bis heute erhaltene Gestalt des Marktplatzes. Gleichzeitig erlebten das Tuchmacher-, Weber- und Schuhmacherhandwerk einen neuen Aufschwung.

Im 18. Jahrhundert wurde Bodenstadt vom Siebenjährigen Krieg betroffen. Im Jahr 1758 musste die Stadt an die preußischen Truppen eine hohe Kontribution entrichten. Weitere schwere Schäden verursachten die Napoleonischen Kriege sowie die verheerenden Brände der Jahre 1787 und 1813, die einen großen Teil der Stadt einschließlich des Schlosses zerstörten. Das Schloss wurde anschließend im Empirestil wiederaufgebaut. Im 19. Jahrhundert stützte sich die Wirtschaft weiterhin auf das Handwerk und zunehmend auch auf die Industrie. Im Jahr 1821 wurde in Boschkau-Hermannsdorf eine Glashütte gegründet, 1860 entstand eine Seidenfabrik, und die Textilindustrie entwickelte sich zu einem bedeutenden Wirtschaftszweig. 1862 erhielt Bodenstadt ein Postamt, 1880 wurde die Freiwillige Feuerwehr gegründet und 1914 die städtische Wasserleitung in Betrieb genommen. Die wirtschaftliche Entwicklung wurde jedoch dadurch gehemmt, dass die geplante Eisenbahnverbindung niemals verwirklicht wurde, was zu einer Stagnation der Industrie und einem Bevölkerungsrückgang führte.

Nach der Gründung der Tschechoslowakei im Jahr 1918 wurde Bodenstadt trotz der überwiegend deutschsprachigen Bevölkerung Bestandteil des neuen Staates, obwohl Bestrebungen bestanden, den Ort an Österreich anzuschließen. Nach dem Münchner Abkommen wurde die Stadt im Oktober 1938 von der deutschen Wehrmacht besetzt und in den Reichsgau Sudetenland (Regierungsbezirk Troppau, Landkreis Mährisch Weißkirchen) eingegliedert. Nach der Befreiung am 8. Mai 1945 folgten die Vertreibung der deutschen Bevölkerung und die Ansiedlung neuer Bewohner aus verschiedenen Teilen der Tschechoslowakei. Obwohl die Textilbetriebe und weitere Unternehmen nach dem Krieg ihre Tätigkeit zunächst wieder aufnahmen, führten die politischen Veränderungen nach dem kommunistischen Umsturz von 1948 zu ihrer schrittweisen Einschränkung, wodurch sich die weitere wirtschaftliche Entwicklung der Stadt deutlich verlangsamte.

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